连云港师范高等专科学校于1999年7月筹备（连政发[1999]124号），1999年9月江苏省人民政府同意（苏政函[1999]98号），2000年3月经国家教育部正式下文（教发[2000]62号）批准，由原连云港教育学院、江苏省连云港师范学校和江苏省海州师范学校三校合并成立。2002年6月，连云港市经济管理干部学校并入连云港师范高等专科学校。学校承担高等专科学历教育和相关科学研究、继续教育、专业培训、学术交流等任务。学校实行省、市共建，以市为主的办学体制，业务上由江苏省教育厅主管，干部由中共连云港市委组织部主管。